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PBCMC

此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅PBCMC

基于置换的分子分类信心

Bioconductor版本:3.4

PBCMC封装表征了对基因表达分类器的不确定性评估,a。k。一种。分子签名,基于排列测试。为了实现这一目标,通过基因标记的置换获得合成模拟受试者。然后,每个合成拍摄对象都针对相应的子类型分类器测试以构建空分布。因此,可以为每个主题提供分类置信度测量,以帮助医生治疗选择。目前,它仅适用于Genefu包中的PAM50实施,但它很容易延伸到其他分子签名。

作者:Cristobal Fresno,德国A. Gonzalez,Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者:Cristobal Fresno

引文(从R内,输入引文(“PBCMC”)):

安装

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文件

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BROWSEVIGNETTES(“PBCMC”)

PDF. r script. 分子阶级的私奔信心
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 分类聚类不同的亚兴基因表达ke微阵列多匹匹莫森正常化oneChannel.QualityControl.rnaseq.软件两种通道MRAMICRARARAY.
版本 1.2.2
在生物导体中以来 BIOC 3.3(R-3.3)(1年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 r(> = 3.3.0),Genefu.
进口 BioBase.生物根系生物相投(> = 1.3.13),平行,重塑2.,网格,ilils,电台, 方法,林马ggplot2.格拉底,grdevices,stats
链接到
建议 乳腺癌Breastcancernki.Breastcancervdx.乳房法人传动系统乳房母亲乳房公务员
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包档案包

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包来源 pbcmc_1.2.2.tar.gz.
Windows二进制文件 pbcmc_1.2.2.2.zip.
Mac OS x 10.9(mavericks) pbcmc_1.2.2.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/pbcmc/tree/release-3.4
包短网址 http://biocidodder.org/packages/pbcmc/
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