要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)Bioclite(“PathView”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

Pathview.

此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Pathview.

基于路径的数据集成和可视化的工具

Bioconductor版本:3.4

PathView是基于路径的数据集成和可视化的工具集。它映射并呈现在相关路径图上的各种生物数据。所有用户都需要提供他们的数据并指定目标路径。PathView自动下载路径图数据,解析数据文件,将用户数据映射到路径,并使用映射数据渲染路径图。此外,PATHVIEW还与大规模和全自动分析的途径和基因集(富集)分析工具无缝集成。

作者:魏晋罗

维护者:yijun luo

引文(从R内,输入引文(“PathView”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)Bioclite(“PathView”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“PATHVIEW”)

PDF. r script. PathView:基于路径的数据集成和可视化
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 不同的亚兴基因表达GenesetenRichment.遗传学graphandnetwork.代谢组学微阵列途径蛋白质组学rnaseq.测序软件系统生物学可视化
版本 1.14.0.
在生物导体中以来 BIOC 2.12(R-3.0)(4年)
执照 GPL(> = 3.0)
依靠 r(> = 2.10),org.hs.eg.db.
进口 keggraph.XML.rghrachviz图形PNG.annotationdbi.凯格斯特,方法,utils
链接到
建议 org.mm.eg.db.运行生物根系
系统要求
加强
URL. http://pathview.uncc.edu/
取决于我 EGSEA.enrichmentbrowser.
进口我 多种tcgabiolinks.
建议我 ClusterProfiler.Gagetata.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 pathview_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件 pathview_1.14.0.zip.
Mac OS x 10.9(mavericks) pathview_1.14.0.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/pathview/tree/release-3.4
包短网址 http://biocidodder.org/packages/pathView/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
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