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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pRoloc。

一个统一的空间蛋白质组学的生物信息学框架

Bioconductor版本:3.4

这个方案实现了模式识别技术quantitiative质谱数据来推断蛋白质亚细胞定位。

作者:Laurent和m . Breckels与和丽莎来自托马斯汉堡和塞缪尔Wieczorek

维修工:Laurent与< lg390在cam.ac.uk >

安装

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文档

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browseVignettes (“pRoloc”)

PDF	R脚本	空间蛋白质组学的迁移学习算法
PDF	R脚本	2011年国际海报:pRoloc——一个统一的细胞器蛋白质组学的生物信息学框架
PDF	R脚本	2014年国际海报:最先进的机器学习管道空间蛋白质组学数据的分析
PDF		机器学习技术在pRoloc可用
PDF		pRoloc教程
HTML	R脚本	注释空间蛋白质组学数据
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻
视频		pRoloc, pRolocdata pRolocGUI

细节

biocViews	分类,聚类,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件
版本	1.14.6
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.15),MSnbase(> = 1.19.20),MLInterfaces(> = 1.37.1)、方法Rcpp(> = 0.10.3),BiocParallel
进口	Biobase,mclust(> = 4.3),脱字符号,e1071,抽样,类,kernlab,晶格,nnet,randomForest,代理,模糊神经网络,BiocGenerics统计数据,dendextend,RColorBrewer,尺度,质量,knitr,mvtnorm,gtools,plyr,ggplot2,biomaRt跑龙套,grDevices图形
链接	Rcpp,RcppArmadillo
建议	testthat,rmarkdown,pRolocdata(> = 1.9.4),roxygen2,synapter,xtable,tsne,hexbin,rgl,BiocStyle,hpar(> = 1.15.3),dplyr,GO.db,AnnotationDbi
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lgatto/pRoloc
BugReports	https://github.com/lgatto/pRoloc/issues
取决于我	pRolocGUI
进口我
建议我	MSnbase,pRolocdata,RforProteomics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	pRoloc_1.14.6.tar.gz
Windows二进制	pRoloc_1.14.6.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9(小牛)	pRoloc_1.14.6.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/proloc/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pRoloc/
包下载报告	下载数据