##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“possom”)

此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见oposSOM。

转录组数据的综合分析

Bioconductor版本:3.4

该包将微阵列表达式数据转换为降维元数据。它提供各种以样本为中心和以组为中心的可视化、样本相似性分析和功能丰富分析。底层的SOM算法结合了特征聚类、多维尺度和降维，以及强大的可视化能力。它可以提取和描述数据中固有的函数表达式模块。

作者:Henry Loeffler-Wirth 和Martin Kalcher

维持者:Henry Loeffler-Wirth

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“possom”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“oposSOM”)

PDF	R脚本	possom用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation,DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,软件,可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0),igraph(> = 1.0.0)
进口	耶鲁大学管理学院,fastICA,scatterplot3d,象图,fdrtool,猿,KernSmooth,biomaRt,Biobase
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://som.izbi.uni-leipzig.de
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	oposSOM_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	oposSOM_1.12.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	oposSOM_1.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/oposSOM/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/oposSOM/
包下载报告	下载数据