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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见oneChannelGUI．

一个图形界面的设计，以方便分析微阵列和miRNA/RNA-seq数据在笔记本电脑

Bioconductor版本:3.4

开发这个包是为了简化对编写R代码经验有限或没有经验的初学者使用Bioconductor工具。该库提供了微阵列基因和外显子水平分析以及miRNA/mRNA-seq数据分析的图形界面

作者:Raffale A Calogero，都灵(意大利)分子生物技术中心生物信息学和基因组学部门

维护者:Raffaele A Calogero < Raffaele。卡洛杰罗在unito， >

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“oneChannelGUI”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“oneChannelGUI”)

PDF	R脚本	oneChannelGUI安装
PDF		oneChannelGUI微阵列外显子级数据分析概述
PDF		oneChannelGUI微阵列基因级数据分析概述
PDF		oneChannelGUI miRNA和RNA-seq数据分析概述
PDF		oneChannelGUI独立函数
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DifferentialExpression，GUI，微阵列，MultipleComparison，OneChannel，预处理，质量控制，RNASeq，测序，软件，StatisticalMethod
版本	1.40.0
在Bioconductor	BioC 2.0 (R-2.5)(10年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase，affylmGUI，tkrplot，tkWidgets，IRanges，Rsamtools(> = 1.13.1),Biostrings，siggenes，嵌合体
进口
链接
建议	注释，genefilter，maSigPro，pamr，pdmclass，ChIPpeakAnno，chipseq，BSgenome，Rgraphviz，affy，annaffy，affyPLM，乘，ssize，sizepower，RankProd，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Rn.eg.db，刨边机，metaArray，MergeMaid，biomaRt，GenomeGraphs，AffyCompatible，rtracklayer，Genominator，EDASeq，limma，DESeq，DEXSeq，goseq，hugene10sttranscriptcluster.db，mogene10sttranscriptcluster.db，ragene10sttranscriptcluster.db，GOstats，AnnotationDbi，preprocessCore，baySeq，HuExExonProbesetLocation，MoExExonProbesetLocation，RaExExonProbesetLocation，雪，RmiR，RmiR.Hs.miRNA，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，R.utils，腰带，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9，BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4，DESeq2，GenomicAlignments，BiocParallel，KEGG.db，miRNApath，miRNAtap，miRNAtap.db
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinformatica.unito.it/oneChannelGUI/
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	oneChannelGUI_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	oneChannelGUI_1.40.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	oneChannelGUI_1.40.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/oneChannelGUI/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/oneChannelGUI/
软件包下载报告	下载数据