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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见mvGST．

多元定向基因集检测

Bioconductor版本:3.4

mvGST提供了独立于平台的工具，用于识别在多个兴趣对比中具有差异活性(向上或向下)的GO术语(基因集)。给定一个单侧p值矩阵(行为基因，列为对比)，mvGST使用元分析方法将每个基因集注释的所有基因的p值组合在一起，然后将每个基因集分类为在每个感兴趣的对比中显着更活跃(1)、更不活跃(-1)或无显着差异活跃(0)。有了多个感兴趣的对比，每个基因集都被分配到一个差异活性的剖面(跨对比)。工具也提供了可视化(在一个GO图)的基因集分类到一个给定的轮廓。

作者:John R. Stevens和Dennis S. Mecham

维护者:John R. Stevens < John . R. Stevens。史蒂文斯在usu.edu>

安装

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文档

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browseVignettes(“mvGST”)

PDF	R脚本	mvGST教程小插图
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，去，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，微阵列，OneChannel，通路，RNASeq，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10.0)，GO.db，Rgraphviz
进口	gProfileR，stringr，topGO，GOstats，注释，AnnotationDbi，图
链接
建议	hgu133plus2.db，org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	mvGST_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	mvGST_1.8.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	mvGST_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/mvGST/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mvGST/
软件包下载报告	下载数据