要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“MultiClust”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅多阵风。
Bioconductor版本:3.4
进行聚类以识别转录组科曲线中的模式,以确定患者的临床相关亚组。特征(基因)选择是该过程的关键和组成部分。目前,有许多特征选择和聚类方法来识别相关基因并执行样本的聚类。然而,选择合适的方法是困难的。此外,可用包不支持广泛的特征选择方法。因此,我们开发了一种称为多阵列的一体化R包,使研究人员能够在轻松选择基因选择和聚类方法的选择。使用多阵击,我们在临床结果的背景下识别了最佳性能的聚类方法。我们的观察结果表明,诸如基于方差的排名等简单的方法对大多数数据集表现良好,只要选择适当数量的基因。然而,不同的基因排名和选择方法仍然与所有研究的方法无关。
作者:Nathan Lawlor [Aut,Cre],Peiyong Guan [Aut],Alec Fabbri [Aut],Krish Karuturi [Aut],Joshy George [Aut]
维护者:Nathan Lawlor
引文(从R内,输入引文(“多阵阵”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“MultiClust”)
HTML. | r script. | 多阵风指南 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 聚类那特征提取那基因表达那软件那生存 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.3(R-3.3)(1年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | |
进口 | 蒙链那CTC.那生存那簇那dendextend.那一张地图,图形,grdevices |
链接到 | |
建议 | kn那贡献那运行那生物根系那预处理核那BioBase.那地理曲线 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | multiciclust_1.4.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | multiclust_1.4.0.zip. |
Mac OS x 10.9(mavericks) | multiciclust_1.4.0.tgz. |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocondion-mirror/multiclust/tree/release-3.4 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/multiclust/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |