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多阵风

此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅多阵风

多阵挛性:用于识别癌症转录组谱中生物相关簇的R包

Bioconductor版本:3.4

进行聚类以识别转录组科曲线中的模式,以确定患者的临床相关亚组。特征(基因)选择是该过程的关键和组成部分。目前,有许多特征选择和聚类方法来识别相关基因并执行样本的聚类。然而,选择合适的方法是困难的。此外,可用包不支持广泛的特征选择方法。因此,我们开发了一种称为多阵列的一体化R包,使研究人员能够在轻松选择基因选择和聚类方法的选择。使用多阵击,我们在临床结果的背景下识别了最佳性能的聚类方法。我们的观察结果表明,诸如基于方差的排名等简单的方法对大多数数据集表现良好,只要选择适当数量的基因。然而,不同的基因排名和选择方法仍然与所有研究的方法无关。

作者:Nathan Lawlor [Aut,Cre],Peiyong Guan [Aut],Alec Fabbri [Aut],Krish Karuturi [Aut],Joshy George [Aut]

维护者:Nathan Lawlor

引文(从R内,输入引文(“多阵阵”)):

安装

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文件

HTML. r script. 多阵风指南
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 聚类特征提取基因表达软件生存
版本 1.4.0
在生物导体中以来 BIOC 3.3(R-3.3)(1年)
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依靠
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包来源 multiciclust_1.4.0.tar.gz.
Windows二进制文件 multiclust_1.4.0.zip.
Mac OS x 10.9(mavericks) multiciclust_1.4.0.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondion-mirror/multiclust/tree/release-3.4
包短网址 http://biocidodder.org/packages/multiclust/
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