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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见msa．

多序列比对

Bioconductor版本:3.4

“msa”包为多个序列比对算法ClustalW、ClustalOmega和Muscle提供了统一的R/Bioconductor接口。所有三种算法都集成在包中，因此，它们不依赖于任何外部软件工具，可用于所有主要平台。多个序列对齐算法由一个使用LaTeX包TeXshade的漂亮打印多个序列对齐的函数补充。

作者:Enrico Bonatesta, Christoph Horejs-Kainrath, Ulrich Bodenhofer

维护者:Ulrich Bodenhofer < Bodenhofer at bioinf.jku.at>

安装

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文档

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browseVignettes (msa)

PDF	R脚本	msa -一个多序列比对的R包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，MultipleComparison，MultipleSequenceAlignment，测序，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(2年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 3.1.0)，方法，Biostrings(> = 2.30.0)
进口	Rcpp(> = 0.11.1),BiocGenerics，IRanges(> = 1.20.0),S4Vectors、工具
链接	Rcpp
建议	Biobase，knitr，seqinr，猿，phangorn
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	http://www.bioinf.jku.at/software/msa/
全靠我
进口我	odseq
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	msa_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	msa_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	msa_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/msa/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/msa/
软件包下载报告	下载数据