安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“马赛克”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅马赛克。
Bioconductor版本:3.4
这个包提供了函数拟合马赛克和MOSAiCS-HMM,统计框架来分析一个样品或两个示例ChIP-seq转录因子的数据绑定和组蛋白修饰。
作者:东峻涌裴分矿,Rene韦尔奇,Sunduz凯尔
维护人员:东峻涌<东峻。钟在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“马赛克”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“马赛克”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“马赛克”)
R脚本 | 马赛克 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,ChIPseq,遗传学,测序,软件,转录 |
版本 | 2.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(6年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(> = 3.0.0)、方法、图形、Rcpp |
进口 | 质量样条函数,晶格,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,GenomeInfoDb,S4Vectors |
链接 | Rcpp |
建议 | mosaicsExample |
SystemRequirements | Perl |
增强了 | 平行 |
URL | http://groups.google.com/group/mosaics_user_group |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | mosaics_2.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | mosaics_2.12.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9(小牛) | mosaics_2.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/mosaics/tree/release - 3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/mosaics/ |
包下载报告 | 下载数据 |