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此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅mmnet。
生物导体版本:3.4
该软件包提供了实现微生物组代谢网络构建和分析。它引入了独特的宏基因组系统生物学方法,将宏基因组数据映射到KEGG全球代谢途径并构建系统级网络。系统级网络和下一个拓扑分析将有很大的帮助,有助于分析各种功能特性,包括元基因组的调节和代谢功能。
作者:Yang Cao,Fei Li
维护者:yang cao
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browsevignettes(“ mmnet”)
R脚本 | mmnet | |
参考手册 |
生物浏览 | GraphSandNetwork,,,,微生物组,,,,途径,,,,测序,,,,软件,,,,系统生物学 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(3年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.14),Igraph,Biom |
进口 | 生物酶,,,,rjsonio,,,,Stringr,,,,RESHAPE2,,,,GGPLOT2,,,,keggrest,,,,plyr,,,,XML,,,,rcurl,,,,flexmix,,,,矩阵,方法,工具 |
链接 | |
建议 | rcytoscape,,,,图形,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | mmnet_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/mmnet/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mmnet/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |