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分析Illumina Infinium DNA甲基化阵列

Bioconductor版本：3.4

分析和可视化Illumina Infinium甲基化阵列的工具。

作者：Kasper Daniel Hansen [Cre，Aut]，Martin Ariee [Aut]，Rafael A. Irtizarry [Aut]，Andrew E. Jaffe [CTB]，Jovana Maksimovic [CTB]，E. Andres Houseman [CTB]，Jean-PhilippeFortin [CTB]，Tim Triche [CTB]，Shan V. Andrews [CTB]

维护者：Kasper Daniel Hansen

安装

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PDF.	r script.	Minfi用户指南
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	德甲基化那DataImport.那差分甲基化那表观遗传学那甲基化阵列那微阵列那多渠道那正常化那预处理那QualityControl.那软件那两种通道
版本	1.20.2
在生物导体中以来	BIOC 2.9（R-2.14）（5.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	方法，生物根系（> = 0.15.3），BioBase.（> = 2.17.8），Genomicranges.那概括分析（> = 1.1.6），生物仪器那Bumphunter.（> = 1.1.9）
进口	S4Vectors.那genomeinfodb.那绞喉那伯普兰那rcolorbrewer.那格子那nor1mix.那siggenes.那林马那预处理核那Illuminaio.那MatrixStats.（> = 0.50.0），蒙链那Genefilter.那nlme.那重塑那大量的那Quadprog.那data.table.那地理曲线，统计，grdevices，图形，utils
链接到
建议	Illuminahumanmethylation450kmanifest.（> = 0.2.0），illuminahumanmethylation450ka​​nno.ilmn12.hg19（> = 0.2.1），minfidata.（> = 0.18.0），minfidatapic.那flowsorted.blood.450k.（> = 1.0.1），运行那消化那生物焦那kn那RAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL.	https://github.com/kasperdanielhansen/minfi.
Bugreports.	https://github.com/kasperdanielhansen/minfi/issues.
取决于我	大梅隆那冠军那骗子那CopyNumber450kdata.那dmrcate.那enmix.那flowsorted.blood.450k.那flowsorted.Cordblood.450K.那flowsorted.cordbloodnorway.450k.那flowsorted.dlpfc.450k.那illuminahumanmethylation27kanno.ilmn12.hg19.那illuminahumanmethylation27kmanifest.那illuminahumanmethylation450ka​​nno.ilmn12.hg19那Illuminahumanmethylation450kmanifest.那illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19.那IlluminahumanMethationPicmanifest.那弥撒那minfidata.那minfidatapic.那sh
进口我	埃尔默那一顿饭那METHYLAID.那弥撒那MissMethyl.那多atAdataset.那Quantro.那Skewr.
建议我	哈曼那rnbeads.
建立报告

包档案包

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包来源	minfi_1.20.2.tar.gz.
Windows二进制文件	minfi_1.20.2.zip.
Mac OS x 10.9（mavericks）	minfi_1.20.2.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocondion-mirror/minfi/tree/release-3.4
包短网址	http://biocidodder.org/packages/minfi/
包裹下载报告	下载统计信息