要安装此软件包，请启动R并输入：
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在大多数情况下，您根本不需要下载包装存档。
甲基库
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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅甲基库。
来自高通量亚硫酸盐测序结果的DNA甲基化分析
生物导体版本：3.4
甲基套件是用于通过高通量亚硫酸盐测序的DNA甲基化分析和注释的R包装。该软件包旨在处理来自RRB及其变体的测序数据，还可以处理目标捕获方法和整个基因组Bisulfite测序。它还具有分析从OXBS-SEQ和TAB-SEQ等实验协议的基本对分辨率数据的函数。需要Perl仅读取SAM文件。
作者：Altuna Akalin [AUT，CRE]，Matthias Kormaksson [aut]，Sheng Li [aut]，Arsene Wabo [CTB]，Adrian Bierling [aut]，Alexander Gosdschan [aut]
维护者：gmail.com上的Altuna Akalin
引用（从r内，输入引用（“甲基容”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持source（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“甲基kit”）
文档
| html | R脚本 | 小插图标题 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | DNAMETHYLATY，，，，甲基，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（0.5岁） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3.0），基因组机（> = 1.18.1），方法 |
| 进口 | iranges，，，，Data.Table（> = 1.9.6），并行，S4VECTORS，，，，GenomeInfodB，，，，克恩斯门茶，，，，QVALUE，，，，emdbook，，，，rsamtools，，，，gtools，，，，fastseg，，，，rtracklayer，，，，mclust，，，，RCPP，，，，r.utils，，，，林玛，grdevices，图形，统计，utils |
| 链接 | RCPP，，，，Rhtslib，，，，Zlibbioc |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，基因组化 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://code.google.com/p/methylkit/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | METHYLKIT_1.0.0.TAR.GZ |
| Windows二进制 | METHYLKIT_1.0.0.ZIP（32-和64位） |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | METHYLKIT_1.0.0.TGZ |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/methylkit/tree/release-3.4 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/methylkit/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
