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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ metagenomefeatures”)

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元全征

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅元全征

探索标记 - 基因序列分类学注释

生物导体版本:3.4

元基因瘤的开发用于探索标记元基因组序列数据集的分类学注释。该软件包可用于探索标记数据库的分类学组成或来自标记 - 基因元基因组实验的注释序列。

作者:Nathan D. Olson,Joseph Nathaniel Paulson,Hector Corrada Bravo

维护者:umiacs.umd.edu>的Nathan D. Olson

引用(从r内,输入引用(“ MetagenomeFeatures”)):

安装

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文档

html R脚本 示例16S注释工作流程
html R脚本 小插图标题
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,基础设施,,,,宏基因组学,,,,微生物组,,,,测序,,,,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(1。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3),生物酶(> = 2.17.8)
进口 生物弦(> = 2.36.4),Shortread(> = 1.26.0),dplyr(> = 0.4.3),Stringr(> = 1.0.0),懒惰(> = 0.1.10),rsqlite(> = 1.0.0),马格里特(> = 1.5),方法(> = 3.3.1),格子(> = 0.20.33),元基因组(> = 1.14.2),(> = 3.5),purrr(> = 0.2.2)
链接
建议 尼特(> = 1.11),MSD16S(> = 0.102.0),测试(> = 0.10.0),rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/hcbravolab/metagenomefeatures
BugReports https://github.com/hcbravolab/metagenomefeatures/issues
取决于我
进口我 GreenGenes13.5MGDB
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 metagenomefeatures_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 metagenomefeatures_1.4.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) metagenomefeatures_1.4.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/metagenomefeatures/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/metagenomefeatures/
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