要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ metagenomefeatures”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅元全征。
生物导体版本:3.4
元基因瘤的开发用于探索标记元基因组序列数据集的分类学注释。该软件包可用于探索标记数据库的分类学组成或来自标记 - 基因元基因组实验的注释序列。
作者:Nathan D. Olson,Joseph Nathaniel Paulson,Hector Corrada Bravo
维护者:umiacs.umd.edu>的Nathan D. Olson
引用(从r内,输入引用(“ MetagenomeFeatures”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ metagenomefeatures”)
html | R脚本 | 示例16S注释工作流程 |
html | R脚本 | 小插图标题 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,基础设施,,,,宏基因组学,,,,微生物组,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(1。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.3),生物酶(> = 2.17.8) |
进口 | 生物弦(> = 2.36.4),Shortread(> = 1.26.0),dplyr(> = 0.4.3),Stringr(> = 1.0.0),懒惰(> = 0.1.10),rsqlite(> = 1.0.0),马格里特(> = 1.5),方法(> = 3.3.1),格子(> = 0.20.33),元基因组(> = 1.14.2),猿(> = 3.5),purrr(> = 0.2.2) |
链接 | |
建议 | 尼特(> = 1.11),MSD16S(> = 0.102.0),测试(> = 0.10.0),rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/hcbravolab/metagenomefeatures |
BugReports | https://github.com/hcbravolab/metagenomefeatures/issues |
取决于我 | |
进口我 | GreenGenes13.5MGDB |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | metagenomefeatures_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | metagenomefeatures_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | metagenomefeatures_1.4.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/metagenomefeatures/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/metagenomefeatures/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |