要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ metagene”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅metagene。
生物导体版本:3.4
该软件包产生了元原子图,以比较选定基因/特征组的DNA相互作用蛋白的行为。BAM文件用于增加分辨率。可以在单个分析中比较一组BAM文件和/或基因组区域组的多重组合。Bootstraping分析用于比较各组并找到具有统计学上不同富集曲线的区域。
作者:Charles Joly Beauparlant
维护者:Charles Joly Beauparlant
引用(从r内,输入引用(“ metagene”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
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html | R脚本 | Metagene简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 结盟,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,遗传学,,,,多重组合,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 2.6.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(2。5年) |
执照 | Artistic-2.0 |文件许可证 |
要看 | r(> = 3.2.0),R6(> = 2.0),基因组机,,,,生物比较 |
进口 | rtracklayer,,,,GPLOTS, 工具,基因组签名,,,,GenomeInfodB,,,,GenomicFeatures,,,,iranges,,,,GGPLOT2,,,,必须,,,,rsamtools,,,,dbchip,,,,矩阵 |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,相似 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/charlesjb/metagene/issues |
取决于我 | 输铁烯 |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | metagene_2.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | metagene_2.6.1.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | metagene_2.6.1.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/metagene/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/metagene/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |