要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“网格”)

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网格

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见网格

网格丰富和语义分析

Bioconductor版本:3.4

MeSH(医学主题标题)是NLM控制的词汇表,用于为MEDLINE/PubMed手动索引文章。MeSH术语通过gendoo、gene2pubmed和RBBH三种方法通过Entrez Gene ID进行关联。这种关联是丰富和语义分析的基础。网格支持基因列表或整个表达谱的富集分析(过度表示和基因集富集分析)。MeSH术语的语义比较为计算基因和基因组之间的相似性提供了定量的方法。网格分别实现了Resnik, Schlicker, Jiang, Lin和Wang提出的五种方法,支持70多个物种。

作者:于广创[aut, cre]

维护人员:guangchuangyu

引文(从R内,输入引用(“网格”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“网格”)

文档

超文本标记语言 R脚本 对网格的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释聚类MultipleComparison软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(0.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.3.1),剂量(> = 2.11.7)
进口 AnnotationDbiGOSemSim(> = 1.99.3),MeSH.db、方法
链接
建议 BiocStyleknitrMeSH.Cel.eg.dbMeSH.Hsa.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL https://guangchuangyu.github.io/meshes
BugReports https://github.com/GuangchuangYu/meshes/issues
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 meshes_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 meshes_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) meshes_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/meshes/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/meshes/
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