要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“网格”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见网格.
Bioconductor版本:3.4
MeSH(医学主题标题)是NLM控制的词汇表,用于为MEDLINE/PubMed手动索引文章。MeSH术语通过gendoo、gene2pubmed和RBBH三种方法通过Entrez Gene ID进行关联。这种关联是丰富和语义分析的基础。网格支持基因列表或整个表达谱的富集分析(过度表示和基因集富集分析)。MeSH术语的语义比较为计算基因和基因组之间的相似性提供了定量的方法。网格分别实现了Resnik, Schlicker, Jiang, Lin和Wang提出的五种方法,支持70多个物种。
作者:于广创[aut, cre]
维护人员:guangchuangyu
引文(从R内,输入引用(“网格”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“网格”)
超文本标记语言 | R脚本 | 对网格的介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,聚类,MultipleComparison,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(0.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.3.1),剂量(> = 2.11.7) |
进口 | AnnotationDbi,GOSemSim(> = 1.99.3),MeSH.db、方法 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,MeSH.Cel.eg.db,MeSH.Hsa.eg.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://guangchuangyu.github.io/meshes |
BugReports | https://github.com/GuangchuangYu/meshes/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | meshes_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | meshes_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | meshes_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/meshes/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/meshes/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |