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安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“maftools”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
maftools
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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅maftools。
总结、分析和可视化加器文件
Bioconductor版本:3.4
于分析和可视化变异注释格式文件从大规模测序研究。这个包提供了各种功能执行最常用的分析癌症基因组学和创建功能丰富的可定制的visualzations以最小的努力。
作者:Anand Mayakonda < anand_mt hotmail.com >
维护人员:Anand Mayakonda < anand_mt hotmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“maftools”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“maftools”)
文档
| HTML | R脚本 | 总结、分析和可视化加器文件 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 分类,DNASeq,DataRepresentation,DriverMutation,FeatureExtraction,FunctionalGenomics,测序,软件,SomaticMutation,VariantAnnotation,可视化 |
| 版本 | 1.0.55 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可 |
| 取决于 | R (> = 3.3) |
| 进口 | data.table,ggplot2(> = 2.0),cowplot,cometExactTest,RColorBrewer,NMF,ggrepel、方法、ComplexHeatmap,mclust,VariantAnnotation,Biostrings,Rsamtools,rjson、网格DPpackage,wordcloudgrDevices,changepoint |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/PoisonAlien/maftools |
| BugReports | https://github.com/PoisonAlien/maftools/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | maftools_1.0.55.tar.gz |
| Windows二进制 | maftools_1.0.55.zip |
| Mac OS X 10.9(小牛) | maftools_1.0.55.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/maftools/tree/release - 3.4 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/maftools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
