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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见kimod．

采用k-表方法集成多个组学数据

Bioconductor版本:3.4

该软件包允许使用混合组学数据(转录组学、蛋白质组学、微阵列芯片、rna-seq数据)，引入以下改进:每个表的距离选项(用于数值和/或分类变量)，所有方法残差矩阵上的bootstrap重采样技术，能够对个体、变量的投影执行置信椭圆，以及双标图方法，以在妥协上投影变量(基因表达)。由于该软件包的主要目的是使用这些技术进行组学数据分析，它包括来自NCI-60细胞系上四个不同微阵列平台(即Agilent, Affymetrix HGU 95, Affymetrix HGU 133和Affymetrix HGU 133plus 2.0)的示例数据。NCI60_4arrays是一个包含NCI-60微阵列数据的列表，每个平台中只有随机选择的几百个基因，以保持包的大小较小。数据与用于实现共惯性分析的包omicade4相同。包中的引用遵循apa -6规范的风格。

作者:Maria Laura Zingaretti, Johanna Altair deme - zambrano, Jose Luis Vicente-Villardon, Jhonny Rafael Demey

维护者:M L Zingaretti < M .lau。Zingaretti在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“kimod”)

PDF	R脚本	在R中集成多个组学数据的k -表方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，GeneExpression，微阵列，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(1年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 3.3)，方法
进口	集群、图形、Biobase
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	kimod_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	kimod_1.2.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	kimod_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/kimod/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/kimod/
软件包下载报告	下载数据