安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“等压线”)

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等压线

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅等压线

标记msm蛋白质组学数据分析和定量的恒压的

Bioconductor版本:3.4

等压线提供方法预处理、标准化和报告生成的定量质谱的蛋白质组学数据分析与等压标签标记,如iTRAQ和TMT。功能模块集成和验证PTM-centric数据集(isobar-PTM)。更多信息在http://www.ms-isobar.org上。

作者:Florian P布雷<弗洛里安。bw gmail.com >和Jacques Colinge , with contributions from Alexey Stukalov , Xavier Robin and Florent Gluck

维护人员:Florian P布雷<弗洛里安。bw gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“等压线”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“等压线”)

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browseVignettes(“等压线”)

PDF R脚本 等压线为开发人员bob电竞体育官网
PDF R脚本 等压线天车的量化的数据集
PDF R脚本 等压线包iTRAQ和TMT蛋白质量化
PDF R脚本 用例等压线包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学,MassSpectrometry,MultipleComparisons,蛋白质组学,质量控制,软件
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 2.9 (r - 2.14)(5.5年)
许可证 LGPL-2
取决于 R (> = 2.10.0),Biobase、统计数据、方法
进口 分配,plyr,biomaRt,ggplot2
链接
建议 MSnbase,OrgMassSpecR,XML,RJSONIO,Hmisc,gplots,RColorBrewer,gridExtra,limma,引导,DBI,质量
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/fbreitwieser/isobar
BugReports https://github.com/fbreitwieser/isobar/issues
取决于我
进口我
建议我 RforProteomics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 isobar_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 isobar_1.20.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛) isobar_1.20.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/isobar/tree/release - 3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/isobar/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网