要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“imageHTS”)

在大多数情况下,根本不需要下载包存档。

imageHTS

此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见imageHTS

高通量显微镜为基础的屏幕分析

Bioconductor版本:3.4

imageHTS是一个R包,专门用于分析高通量显微镜为基础的屏幕。该包提供了一个模块化和可扩展的框架,通过web界面对单元格进行分割,提取定量单元格特征,预测单元格类型和浏览屏幕数据。设计用于分布式环境,imageHTS提供了对远程数据的标准化访问,并促进了高通量基于显微镜的数据集的传播。

作者:Gregoire Pau, Zhang Xian, Michael Boutros, Wolfgang Huber

维护者:约瑟夫·巴里<约瑟夫。巴里在embl.de >

引文(从R中输入引用(“imageHTS”)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“imageHTS”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“imageHTS”)

PDF R脚本 基于imagets的高通量显微镜屏幕分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBasedAssays,预处理,软件,可视化
版本 1.24.0
Bioconductor自 BioC 2.7 (R-2.12)(6.5年)
许可证 lgpl - 2.1
取决于 R (> = 2.9.0),EBImage(> = 4.3.12),cellHTS2(> = 2.10.0)
进口 工具,Biobase,hwriter、方法、vsn,统计,跑龙套,e1071
链接
建议 BiocStyle,质量
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 PGPC,phenoDist
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 imageHTS_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 imageHTS_1.24.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) imageHTS_1.24.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/imageHTS/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/imageHTS/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-关于生物导体封装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网