要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“imageHTS”)
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见imageHTS。
Bioconductor版本:3.4
imageHTS是一个R包,专门用于分析高通量显微镜为基础的屏幕。该包提供了一个模块化和可扩展的框架,通过web界面对单元格进行分割,提取定量单元格特征,预测单元格类型和浏览屏幕数据。设计用于分布式环境,imageHTS提供了对远程数据的标准化访问,并促进了高通量基于显微镜的数据集的传播。
作者:Gregoire Pau, Zhang Xian, Michael Boutros, Wolfgang Huber
维护者:约瑟夫·巴里<约瑟夫。巴里在embl.de >
引文(从R中输入引用(“imageHTS”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“imageHTS”)
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“imageHTS”)
R脚本 | 基于imagets的高通量显微镜屏幕分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,预处理,软件,可视化 |
版本 | 1.24.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.7 (R-2.12)(6.5年) |
许可证 | lgpl - 2.1 |
取决于 | R (> = 2.9.0),EBImage(> = 4.3.12),cellHTS2(> = 2.10.0) |
进口 | 工具,Biobase,hwriter、方法、vsn,统计,跑龙套,e1071 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,质量 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | PGPC,phenoDist |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | imageHTS_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | imageHTS_1.24.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | imageHTS_1.24.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/imageHTS/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/imageHTS/ |
包下载报告 | 下载数据 |