要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ hireadsprocessor”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Hireadsprocessor。
生物导体版本:3.4
HireadsProcessor包含一组功能,使用户可以处理使用任何平台测序的LM-PCR产品。给定一个包含用于反复分解和样品元数据的参数的Excel/TXT文件,该功能自动化适配器的修剪和基因组产物的识别。进一步处理QC和丰度定量的基因组产物。
作者:nirav v malani
维护者:nirav v malani
引用(从r内,输入引用(“ Hireadsprocessor”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
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html | R脚本 | 使用HireadsProcessor |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 预处理,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | 生物弦,,,,基因组签名,,,,生物比较,,,,Hiannotator,r(> = 3.0) |
进口 | Soniclength,,,,dplyr,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,rsffreader,,,,readxl, 方法 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,测试 |
系统要求 | blat,UCSC HG18以2位格式用于布拉特 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | hireadsprocessor_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | hireadsprocessor_1.10.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/hireadsprocessor/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/hireadsprocessor/ |
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