要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“石墨”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见石墨。
Bioconductor版本:3.4
从Biocarta, HumanCyc, KEGG, NCI, Panther, Reactome和SPIKE数据库中导出的路径拓扑图对象。
作者:Gabriele Sales < Gabriele。unipd.it的销售额为100亿美元,Enrica Calura
维护者:Gabriele Sales < Gabriele。unipd.it的销售额为100亿美元
引用(来自R,输入引用(石墨)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“石墨”)
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(石墨)
R脚本 | 来自路径拓扑环境的GRAPH交互作用 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BioCarta,GraphAndNetwork,KEGG,网络,通路,Reactome,软件,ThirdPartyClient |
版本 | 1.20.1 |
在Bioconductor中 | BioC 2.9 (R-2.14)(5.5岁) |
许可证 | AGPL-3 |
取决于 | R(>= 2.10),方法 |
进口 | AnnotationDbi,图,统计,utils,rappdirs |
链接 | |
建议 | BiocStyle,hgu133plus2.db,org.Hs.eg.db,SPIA(> = 2.2),topologyGSA(> = 1.4.0),限幅器,所有,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | DEGraph,RCytoscape,RCy3 |
URL | |
这取决于我 | ToPASeq |
进口我 | facopy,mogsa,ReactomePA |
建议我 | 限幅器 |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | graphite_1.20.1.tar.gz |
Windows二进制 | graphite_1.20.1.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | graphite_1.20.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/graphite/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/graphite/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |