要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“石墨”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

石墨

这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见石墨

来自路径拓扑环境的GRAPH交互作用

Bioconductor版本:3.4

从Biocarta, HumanCyc, KEGG, NCI, Panther, Reactome和SPIKE数据库中导出的路径拓扑图对象。

作者:Gabriele Sales < Gabriele。unipd.it的销售额为100亿美元,Enrica Calura , Chiara Romualdi

维护者:Gabriele Sales < Gabriele。unipd.it的销售额为100亿美元

引用(来自R,输入引用(石墨)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“石墨”)

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(石墨)

PDF R脚本 来自路径拓扑环境的GRAPH交互作用
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BioCartaGraphAndNetworkKEGG网络通路Reactome软件ThirdPartyClient
版本 1.20.1
在Bioconductor中 BioC 2.9 (R-2.14)(5.5岁)
许可证 AGPL-3
取决于 R(>= 2.10),方法
进口 AnnotationDbi,统计,utils,rappdirs
链接
建议 BiocStylehgu133plus2.dborg.Hs.eg.dbSPIA(> = 2.2),topologyGSA(> = 1.4.0),限幅器所有testthat
SystemRequirements
增强了 DEGraphRCytoscapeRCy3
URL
这取决于我 ToPASeq
进口我 facopymogsaReactomePA
建议我 限幅器
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 graphite_1.20.1.tar.gz
Windows二进制 graphite_1.20.1.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) graphite_1.20.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/graphite/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/graphite/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表-用于包开发人员bob电竞体育官网