要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“goseq”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见goseq.
Bioconductor版本:3.4
检测基因本体和/或其他在RNA-seq数据中过度/不足的用户定义类别
作者:马修·杨
维护者:Nadia Davidson < Nadia。戴维森在mcri.edu.au>,安东尼霍金斯<安东尼。霍金斯在McRi.edu.au >
引文(从R内,输入引用(“goseq”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“goseq”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“goseq”)
R脚本 | goseq用户指南 | |
参考手册 |
biocViews | 去,GeneExpression,RNASeq,测序,软件,转录 |
版本 | 1.26.0 |
在Bioconductor | BioC 2.6 (R-2.11)(7年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.11.0),BiasedUrn,geneLenDataBase(> = 1.9.2) |
进口 | mgcv,图形,统计,utils,AnnotationDbi,GO.db,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | 刨边机,org.Hs.eg.db,rtracklayer |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | rgsepd |
进口我 | 冠军,击杀 |
建议我 | oneChannelGUI |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | goseq_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | goseq_1.26.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | goseq_1.26.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/goseq/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/goseq/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |