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此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Girafe.。

基因组间隔和读取对齐的功能探索

Bioconductor版本：3.4

包装'Girafe'处理来自下一代测序数据的对齐读取的基因组级表示。它包含一个对象类，用于使基因组间隔的详细描述具有对齐的读取和功能，用于比较，可视化，导出和使用这种间隔和对齐的读取。因此，包装与包装短read，绞盘和基因组内的链接相互作用并提供联系。

作者：Joern Toedling，来自Constance Ciaudo，Olivier Voinnet，Edith Heard，Emmanuel Barillot和Wolfgang Huber的贡献

维护者：J. Toedling

安装

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文件

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Browsevignettes（“Girafe”）

PDF.	r script.	基因组间隔和读取对齐的功能探索
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	测序那软件
版本	1.26.0
在生物导体中以来	BIOC 2.6（R-2.11）（7年）
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 2.10.0），方法，生物根系（> = 0.13.8），S4Vectors.（> = 0.7.21），RSAMTOOLS.那间隔（> = 0.13.1），缩短（> = 1.3.21），GenomeIntervals.（> = 1.25.1），网格
进口	方法，BioBase.那生物仪器，图形，grdevices，stats，utils，绞喉（> = 2.3.23）
链接到
建议	大量的那org.mm.eg.db.那rcolorbrewer.
系统要求
加强	GenomeIntervals.
URL.
取决于我
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	girafe_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件	girafe_1.26.0.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.9（mavericks）	girafe_1.26.0.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/girafe/tree/release-3.4
包短网址	http://biocidodder.org/packages/girafe/
包裹下载报告	下载统计信息