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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gespeR。

Gene-Specific表型估计量

Bioconductor版本:3.4

估计gene-specific表型从脱靶困惑RNAi屏幕。每个核的表现型建模是基于目标和非目标基因,使用一个正规化的线性回归模型。

作者:费边Schmich

维修工:费边Schmich <费边。在bsse.ethz.ch schmich >

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文档

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PDF	R脚本	R包deconvoluting脱靶困惑RNAi屏幕
PDF		参考手册

细节

biocViews	CellBasedAssays,GeneTarget,预处理,回归,软件,可视化
版本	1.6.1
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	方法、图形ggplot2R (> = 2.10)
进口	矩阵,glmnet,cellHTS2,Biobase,biomaRt,doParallel平行,foreach,reshape2,dplyr
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cbg.ethz.ch/software/gespeR
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	gespeR_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	gespeR_1.6.1.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	gespeR_1.6.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/gesper/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gespeR/
包下载报告	下载数据