要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genotypeypeeval”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Genotypeeval。
生物导体版本:3.4
使用GVCF或VCF并报告指标以评估呼叫质量。
作者:詹妮弗·汤姆[AUT,CRE]
维护者:jennifer tom
引用(从r内,输入引用(“ Genotypeeval”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genotypeypeeval”)
html | R脚本 | genotypeeval_vignette |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 批处理效应,,,,DataImport,,,,遗传学,,,,SNP,,,,测序,,,,软件,,,,变体 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(1。5年) |
执照 | 文件许可证 |
要看 | r(> = 3.2.0),变体 |
进口 | GGPLOT2,,,,rtracklayer,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,iranges, 方法,生物比较 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,测试,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | genotypeeval_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | genotypeeval_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | genotypeeval_1.4.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/genotypeeval/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/genotypeeval/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |