要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genotypeypeeval”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Genotypeeval

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Genotypeeval

GVCF或VCF文件的QA/QC

生物导体版本:3.4

使用GVCF或VCF并报告指标以评估呼叫质量。

作者:詹妮弗·汤姆[AUT,CRE]

维护者:jennifer tom

引用(从r内,输入引用(“ Genotypeeval”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genotypeypeeval”)

文档

html R脚本 genotypeeval_vignette
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 批处理效应,,,,DataImport,,,,遗传学,,,,SNP,,,,测序,,,,软件,,,,变体
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(1。5年)
执照 文件许可证
要看 r(> = 3.2.0),变体
进口 GGPLOT2,,,,rtracklayer,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,iranges, 方法,生物比较
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 genotypeeval_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 genotypeeval_1.4.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) genotypeeval_1.4.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/genotypeeval/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genotypeeval/
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