要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“genoset”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见genoset.
Bioconductor版本:3.4
GenoSet提供了一个扩展的rangedsummarizeexperiment类与额外的API特性。这个类提供了方便和快速的方法来处理分段基因组数据。此外,GenoSet提供了RleDataFrame类,用于存储多个样本沿基因组运行的数据,并提供非常快速的任意行集(基因组区域)的摘要。
作者:Peter M. Haverty
维护者:Peter M. Haverty < phverty at gene.com>
引文(从R内,输入引用(“genoset”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“genoset”)
超文本标记语言 | R脚本 | genoset |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariation,DataRepresentation,基础设施,微阵列,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 1.30.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(6年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),BiocGenerics(> = 0.11.3),GenomicRanges(> = 1.17.19),SummarizedExperiment(> = 1.1.6) |
进口 | S4Vectors(> = 0.9.25),GenomeInfoDb(> = 1.1.3),IRanges(>= 2.5.12),方法,图形 |
链接 | |
建议 | RUnit,knitr,BiocStyle,rmarkdown,DNAcopy统计数据,BSgenome,Biostrings |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行 |
URL | https://github.com/phaverty/genoset |
全靠我 | |
进口我 | methyAnalysis,VegaMC |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | genoset_1.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | genoset_1.30.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | genoset_1.30.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/genoset/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/genoset/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |