要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“genoset”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

genoset

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见genoset

拷贝数分析方法的范围总结实验

Bioconductor版本:3.4

GenoSet提供了一个扩展的rangedsummarizeexperiment类与额外的API特性。这个类提供了方便和快速的方法来处理分段基因组数据。此外,GenoSet提供了RleDataFrame类,用于存储多个样本沿基因组运行的数据,并提供非常快速的任意行集(基因组区域)的摘要。

作者:Peter M. Haverty

维护者:Peter M. Haverty < phverty at gene.com>

引文(从R内,输入引用(“genoset”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“genoset”)

文档

超文本标记语言 R脚本 genoset
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariationDataRepresentation基础设施微阵列单核苷酸多态性软件
版本 1.30.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(6年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),BiocGenerics(> = 0.11.3),GenomicRanges(> = 1.17.19),SummarizedExperiment(> = 1.1.6)
进口 S4Vectors(> = 0.9.25),GenomeInfoDb(> = 1.1.3),IRanges(>= 2.5.12),方法,图形
链接
建议 RUnitknitrBiocStylermarkdownDNAcopy统计数据,BSgenomeBiostrings
SystemRequirements
增强了 平行
URL https://github.com/phaverty/genoset
全靠我
进口我 methyAnalysisVegaMC
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 genoset_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 genoset_1.30.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) genoset_1.30.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/genoset/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/genoset/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网