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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见geecc．

基因集富集分析扩展到权数立方

Bioconductor版本:3.4

使用对数线性模型对两个(基于列联表)或三个类别(列联立方)的基因集富集进行超几何和卡方检验。分类可以是差异表达基因、GO术语、序列长度、GC含量、染色体位置、系层、分化层、....

作者:Markus Boenn

维护者:Markus Boenn < Markus。Boenn at ufz.de>

安装

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文档

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PDF	R脚本	geecc用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion，去，GeneExpression，GeneSetEnrichment，微阵列，RNASeq，软件，StatisticalMethod，转录，WorkflowStep
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 3.3.0)，方法
进口	质量，hypergea1.3.0(> =版本),gplots，Rcpp(>= 0.11.3)，图形，统计，utils
链接	Rcpp
建议	hgu133plus2.db，GO.db，AnnotationDbi
SystemRequirements	Rcpp
增强了
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全靠我
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建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	geecc_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	geecc_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	geecc_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/geecc/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geecc/
软件包下载报告	下载数据