要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“fmcsR”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见fmcsR.
Bioconductor版本:3.4
fmcsR包引入了一种高效的最大公共子结构(MCS)算法,结合了一种新颖的匹配策略,允许两个小分子共享的子结构中的原子和/或键不匹配。由此产生的柔性MCSs (FMCSs)通常比严格的MCSs更大,从而在其源结构中识别更多的共同特征,以及在寻找结构相似性较弱的化合物时具有更高的灵敏度。fmcsR包提供了几个实用程序来使用FMCS算法进行成对复合比较、结构相似性搜索和聚类。
作者:王燕,泰勒·贝克曼,凯文·霍兰,托马斯·格克
维护者:Thomas Girke < Thomas。Girke在ucr.edu>
引文(从R内,输入引用(“fmcsR”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“fmcsR”)
超文本标记语言 | R脚本 | fmcsR |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | BiomedicalInformatics,CellBasedAssays,Cheminformatics,聚类,DataImport,基础设施,MicrotitrePlateAssay,遗传药理学,药物基因组学,蛋白质组学,软件,可视化 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10.0),ChemmineR、方法 |
进口 | RUnit、方法、ChemmineR,BiocGenerics、并行 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,knitcitations,knitrBootstrap |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/girke-lab/fmcsR |
全靠我 | |
进口我 | Rcpi |
建议我 | ChemmineR |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | fmcsR_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | fmcsR_1.16.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | fmcsR_1.16.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/fmcsR/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/fmcsR/ |
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