要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“flowWorkspace”)
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见flowWorkspace。
Bioconductor版本:3.4
这个包的目的是便于在flowJo中对自动门控方法和手动门控方法进行比较。这个包允许你导入基本的flowJo工作区到BioConductor,并使用flowCore功能从flowJo复制门。执行控制层次结构、样本组、补偿和转换,以便输出与flowJo分析匹配。
作者:Greg Finak, Mike Jiang
维护者:Greg Finak
引文(从R中输入引用(“flowWorkspace”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“flowWorkspace”)
超文本标记语言 | R脚本 | 如何合并GatingSets |
超文本标记语言 | R脚本 | 如何绘制门控数据 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 安装 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,FlowCytometry,预处理,软件 |
版本 | 3.20.5 |
Bioconductor自 | BioC 2.9 (R-2.14)(5.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.16.0),flowCore(> = 1.39.9),ncdfFlow(> = 2.19.5) |
进口 | Biobase,BiocGenerics,图、图形、晶格,方法,stats, stats4, utils,RBGL,XML、工具、gridExtra,Rgraphviz,data.table,dplyr,latticeExtra,Rcpp,RColorBrewer,stringr,尺度,flowViz |
链接 | Rcpp,黑洞(> = 1.62.0-1) |
建议 | testthat,flowWorkspaceData,RSVGTipsDevice,knitr,ggcyto |
SystemRequirements | xml2, GNU使 |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | flowStats,ggcyto,openCyto,限定符 |
进口我 | CytoML,openCyto,限定符 |
建议我 | 指南针,flowClust,flowCore |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | flowWorkspace_3.20.5.tar.gz |
Windows二进制 | flowWorkspace_3.20.5.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | flowWorkspace_3.20.5.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/flowWorkspace/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/flowWorkspace/ |
包下载报告 | 下载数据 |