要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ fgsea”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

fgsea

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅fgsea

快速基因集富集分析

生物导体版本:3.4

该软件包实现了一种用于快速基因集富集分析的算法。使用快速算法可以进行更多的排列并获得更细的粒子p值,从而可以使用精确的Stantard方法进行多种假设校正。

作者:Alexey Sergushichev [AUT,CRE]

维护者:gmail.com上的Alexey Sergushichev

引用(从r内,输入引用(“ FGSEA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ fgsea”)

文档

html R脚本 使用FGSEA软件包
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,途径,,,,软件
版本 1.0.2
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(0.5岁)
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看 r(> = 3.3),RCPP
进口 Data.Table,,,,生物比较,统计GGPLOT2(> = 2.2.0),栅格, 网格,FastMatch
链接 RCPP
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Reactome.db,,,,AnnotationDbi, 平行
系统要求 C ++ 11
增强
URL https://github.com/ctlab/fgsea/
BugReports https://github.com/ctlab/fgsea/issues
取决于我
进口我 剂量,,,,钢琴
建议我 pi
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 fgsea_1.0.2.2.tar.gz
Windows二进制 fgsea_1.0.2.2.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.9(Mavericks) fgsea_1.0.2.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/fgsea/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/fgsea/
软件包下载报告 下载统计

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