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基于特征的关联和基因集富集癌拷贝数改变分析

Bioconductor版本：3.4

Facopy是用于微调癌症CNA关联建模的R包。关联是直接测量的感兴趣的基因组特征，并且在基因的情况下，由于数据的新内部处理，可以进行下游基因集富集分析。该软件开启了一种系统地仔细地审查肿瘤表型的CNA分布的差异，例如与肿瘤类型，位置和进展相关的那些。目前，支持来自11种不同方法的输出格式，用于分析来自全基因组/外壳测序和SNP微阵列的数据。还支持多种基因组，改变类型和可变类型。

作者：David Mosen-Ansorena

维护者：David Mosen-Ansorena

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文本		消息

细节

Biocviews.	复印机那GenesetenRichment.那遗传学那基因组那微阵列那测序那软件那可视化
版本	1.8.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.0（R-3.1）（2.5岁）
执照	cc by-nc 4.0
依靠	R（> = 3.0），方法，CGDSR.（> = 1.1.30），硬币（> = 1.0），ggplot2.那格拉底那Facopy.Annot.， 网格
进口	注释那data.table.那剂量那原因那go.db.那古司裤那石墨那iGraph.那S4Vectors.那绞喉那大量的那NNET.那重塑2.那rghrachviz那秤
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包档案包

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包来源	facopy_1.8.0.tar.gz.
Windows二进制文件	facopy_1.8.0.zip.
Mac OS x 10.9（mavericks）	facopy_1.8.0.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/facopy/tree/release-3.4
包短网址	http://biocidodder.org/packages/facopy/
包裹下载报告	下载统计信息