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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“eegc”)

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eegc

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅eegc

基因工程评价的分类(eegc)

Bioconductor版本:3.4

这个包了评估细胞工程流程直接分化的干细胞或转换主要细胞转分化的体细胞基于高通量基因表达数据筛选通过DNA微阵列或RNA序列。包从三种类型的基因表达谱作为输入样本:(i)体细胞或干细胞分化(反式)(工程过程的输入),(2)诱导细胞评估(工程过程的输出)和(3)目标主要细胞(参考输出)。计划执行差异基因表达分析每两两样本比较识别和评估样本的转录差异3类型(输入、输出、引用)。理想的目标是诱导和主要参考细胞显示重叠的概要文件,既不同于原始细胞。

作者:小袁,孟,克里斯汀·纳尔迪尼香港美地

维护人员:小袁周< zhouxiaoyuan picb.ac.cn >

从内部引用(R,回车引用(“eegc”)):

安装

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PDF R脚本 基因工程评价的分类(eegc)
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression,GeneExpression,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GeneTarget,微阵列,RNASeq,测序,软件
版本 1.0.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 3.3.0)
进口 R.utils,gplots,系统网络体系结构(sna),wordcloud,igraph,pheatmap,刨边机,DESeq2,clusterProfiler,S4Vectors,ggplot2,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,limma,剂量,AnnotationDbi
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包档案

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包的来源 eegc_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 eegc_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛) eegc_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/eegc/tree/release - 3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/eegc/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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