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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见diffloop．

从染色质拓扑数据识别差异DNA环

Bioconductor版本:3.4

一套用于子集、可视化、注释和统计分析一个或多个ChIA-PET实验或其他推断染色质环的分析结果的工具。

作者:Caleb Lareau [aut, cre]， Martin Aryee [aut]

维护者:Caleb Lareau

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

超文本标记语言	R脚本	diffloop:从染色质拓扑数据中识别差异DNA环。
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，去，预处理，质量控制，软件，可视化
版本	1.2.2
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(1年)
许可证	MIT +文件许可
取决于
进口	方法,GenomicRanges，foreach，plyr，dplyr，reshape2，ggplot2，matrixStats，寿司，刨边机，locfit，statmod，biomaRt，GenomeInfoDb，S4Vectors，IRanges， grDevices，图形，统计，utils，Biobase，readr，data.table，rtracklayer，pbapply，limma
链接
建议	DESeq2，diffloopdata，ggrepel，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/aryeelab/diffloop
BugReports	https://github.com/aryeelab/diffloop/issues
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进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	diffloop_1.2.2.tar.gz
Windows二进制	diffloop_1.2.2.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	diffloop_1.2.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/diffloop/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/diffloop/
软件包下载报告	下载数据