要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ddgraph”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

ddgraph

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见ddgraph

区分图形建模的直接和间接交互作用

Bioconductor版本:3.4

区分基因调控中的直接和间接相互作用,并从高度相关的变量(如转录因子结合谱)推断组合代码。该包实现了邻域一致PC算法(NCPC),并绘制了直接依赖图来表示围绕目标变量的依赖结构。该包还提供了与其他图形建模(贝叶斯网络)包的统一接口,用于区分直接和间接交互。

作者:Robert Stojnic

维护者:Robert Stojnic < Robert。Stojnic在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“ddgraph”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ddgraph”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ddgraph”)

PDF R脚本 ddgraph包的概述
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GraphAndNetwork软件
版本 1.18.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年)
许可证 GPL-3
取决于 、方法、Rcpp
进口 bnlearn(> = 2.8),gtoolspcalgRColorBrewerplotrix质量
链接 Rcpp
建议 Rgraphvize1071ROCRtestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 ddgraph_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 ddgraph_1.18.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) ddgraph_1.18.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ddgraph/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ddgraph/
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Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网