要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ddgraph”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见ddgraph.
Bioconductor版本:3.4
区分基因调控中的直接和间接相互作用,并从高度相关的变量(如转录因子结合谱)推断组合代码。该包实现了邻域一致PC算法(NCPC),并绘制了直接依赖图来表示围绕目标变量的依赖结构。该包还提供了与其他图形建模(贝叶斯网络)包的统一接口,用于区分直接和间接交互。
作者:Robert Stojnic
维护者:Robert Stojnic < Robert。Stojnic在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“ddgraph”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ddgraph”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ddgraph”)
R脚本 | ddgraph包的概述 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GraphAndNetwork,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | 图、方法、Rcpp |
进口 | bnlearn(> = 2.8),gtools,pcalg,RColorBrewer,plotrix,质量 |
链接 | Rcpp |
建议 | Rgraphviz,e1071,ROCR,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ddgraph_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | ddgraph_1.18.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | ddgraph_1.18.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ddgraph/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ddgraph/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |