安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“dSimer”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅dSimer。
Bioconductor版本:3.4
dSimer 9 R包提供计算方法测量disease-disease相似,包括一个标准的余弦相似性度量和八个基于函数的方法。疾病相似矩阵获得这九个方法可以通过热图可视化和网络。生物数据广泛用于disease-disease关联研究也由dSimer提供。
作者:李敏<港mail.csu.edu.cn >,彭倪< nipeng csu.edu.cn >黄来自范Zhihui和萍。
维护人员:彭倪< nipeng csu.edu.cn >
从内部引用(R,回车引用(“dSimer”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“dSimer”)
HTML | R脚本 | 集成相似疾病的方法 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 网络,软件,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.3.0),igraph(> = 1.0.1) |
进口 | 统计数据,Rcpp(> = 0.11.3),ggplot2,reshape2,GO.db,org.Hs.eg.db,AnnotationDbi、图形 |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | dSimer_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | dSimer_1.0.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9(小牛) | dSimer_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/dsimer/tree/release - 3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/dSimer/ |
包下载报告 | 下载数据 |