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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见customProDB．

从NGS数据生成定制的蛋白质数据库，以RNA-Seq数据为重点，用于蛋白质组学搜索。

Bioconductor版本:3.4

从RNA-Seq数据生成定制的蛋白质序列数据库，用于蛋白质组学搜索

作者:王晓静

维护者:xiaojing wang

安装

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文档

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browseVignettes(“customProDB”)

PDF	R脚本	customProDB简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，MassSpectrometry，蛋白质组学，RNASeq，单核苷酸多态性，软件，转录
版本	1.14.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.0.1)，IRanges，AnnotationDbi，biomaRt
进口	S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，Rsamtools(> = 1.10.2),GenomicAlignments，Biostrings(> = 2.26.3之前),GenomicFeatures(> = 1.17.13),biomaRt(> = 2.17.1),stringr，RCurl，plyr，VariantAnnotation(> = 1.13.44),rtracklayer，RSQLite，AnnotationDbi
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	PGA
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	customProDB_1.14.1.tar.gz
Windows二进制	customProDB_1.14.1.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	customProDB_1.14.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/customProDB/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/customProDB/
软件包下载报告	下载数据