要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cummeRbund”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见腰带.
Bioconductor版本:3.4
允许持久存储,访问,探索,和操作袖扣高通量测序数据。此外,还为常用的可视化提供了许多绘图函数。
作者:L.戈夫,C.特拉普内尔,D.凯利
维护者:Loyal A. Goff
引文(从R内,输入引用(腰带)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cummeRbund”)
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browseVignettes(腰带)
R脚本 | CummeRbund用户指南 | |
R脚本 | 示例腰带工作流程 | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,聚类,DataImport,DataRepresentation,DifferentialExpression,GeneExpression,HighThroughputSequencing,HighThroughputSequencingData,基础设施,MultipleComparisons,质量控制,RNAseq,RNAseqData,软件,可视化 |
版本 | 2.16.0 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(5.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.7.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),RSQLite,ggplot2,reshape2,fastcluster,rtracklayer,Gviz |
进口 | 方法,plyr,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),Biobase |
链接 | |
建议 | 集群,plyr,NMFN,stringr,GenomicFeatures,GenomicRanges,rjson |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | meshr,连接工具 |
进口我 | |
建议我 | oneChannelGUI |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | cummeRbund_2.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | cummeRbund_2.16.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | cummeRbund_2.16.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/cummeRbund/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cummeRbund/ |
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