要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ csaw”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

CSAW

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅CSAW

用窗户分析的芯片序列分析

生物导体版本:3.4

通过滑动窗口检测芯片序列数据中的差异结合区域,并采用标准化和适当的FDR控制方法。

作者:aaron lun ,gordon smyth

维护者:aaron lun

引用(从r内,输入引用(“ CSAW”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ csaw”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ CSAW”)

PDF CSAW小插图
PDF csawuserguide.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,差异词,,,,遗传学,,,,多重组合,,,,正常化,,,,测序,,,,软件
版本 1.8.1
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3.0),基因组机,,,,总结性特征(> = 1.1.6),生物比较
进口 rsamtools,,,,EDGER,,,,林玛,,,,GenomicFeatures,,,,AnnotationDbi, 方法,S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,生物基因,,,,Rhtslib,统计
链接 Rhtslib,,,,Zlibbioc
建议 org.mm.eg.db,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 Diffhic
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 csaw_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 csaw_1.8.1.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.9(Mavericks) CSAW_1.8.1.TGZ
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/csaw/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/csaw/
软件包下载报告 下载统计

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