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在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
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此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅CSAW。
生物导体版本:3.4
通过滑动窗口检测芯片序列数据中的差异结合区域,并采用标准化和适当的FDR控制方法。
作者:aaron lun
维护者:aaron lun
引用(从r内,输入引用(“ CSAW”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CSAW”)
CSAW小插图 | ||
csawuserguide.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,差异词,,,,遗传学,,,,多重组合,,,,正常化,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.8.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3.0),基因组机,,,,总结性特征(> = 1.1.6),生物比较 |
进口 | rsamtools,,,,EDGER,,,,林玛,,,,GenomicFeatures,,,,AnnotationDbi, 方法,S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,生物基因,,,,Rhtslib,统计 |
链接 | Rhtslib,,,,Zlibbioc |
建议 | org.mm.eg.db,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | Diffhic |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | csaw_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | csaw_1.8.1.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | CSAW_1.8.1.TGZ |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/csaw/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/csaw/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |