要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ crossmeta”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
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此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅杂交。
生物导体版本:3.4
实施Affymentrix,Illumina和Agilent微阵列数据的跨平台和跨物种荟萃分析。该软件包可以自动执行常见任务,例如下载,正常化和注释RAW GEO数据。用户界面使每个对比度和研究都可以轻松选择控制和治疗样本。该输入用于随后的替代变量分析(模型未划分的变异源)和差异表达分析。差异表达值的最终荟萃分析可以包括仅在一部分研究中测量的基因。
作者:亚历克斯·皮克林
维护者:Alex Pickering
引用(从r内,输入引用(“ Crossmeta”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
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html | R脚本 | 十字架小插图 |
参考手册 | ||
文本 | 执照 |
生物浏览 | 注解,,,,批处理效应,,,,差异性,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,软件,,,,组织血液阵列,,,,转录 |
版本 | 1.0.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(0.5岁) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | R(> = 3.3) |
进口 | 副词(> = 1.50.0),affxparser(> = 1.44.0),AnnotationDbi(> = 1.34.4),生物酶(> = 2.32.0),生物基因(> = 0.18.0),Biocinstaller(> = 1.22.3),DT(> = 0.2),Data.Table(> = 1.9.6),fdrtool(> = 1.2.15),地球(> = 2.38.4),林玛(> = 3.28.17),矩阵(> = 0.50.2),元(> = 3.1.2),miniui(> = 0.1.1),奥利戈(> = 1.36.1),潘德(> = 0.6.0),rcolorbrewer(> = 1.1.2),rdrop2(> = 0.7.0),Stringr(> = 1.0.0),SVA(> = 3.20.0),闪亮的(> = 0.13.2) |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,Lydata,,,,org.hs.eg.db,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | CCMAP |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | crossmeta_1.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | crossmeta_1.0.1.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | crossmeta_1.0.1.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/crossmeta/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/crossmeta/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |