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##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ crossmeta”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

杂交

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅杂交

微阵列数据的跨平台荟萃分析

生物导体版本:3.4

实施Affymentrix,Illumina和Agilent微阵列数据的跨平台和跨物种荟萃分析。该软件包可以自动执行常见任务,例如下载,正常化和注释RAW GEO数据。用户界面使每个对比度和研究都可以轻松选择控制和治疗样本。该输入用于随后的替代变量分析(模型未划分的变异源)和差异表达分析。差异表达值的最终荟萃分析可以包括仅在一部分研究中测量的基因。

作者:亚历克斯·皮克林

维护者:Alex Pickering

引用(从r内,输入引用(“ Crossmeta”)):

安装

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文档

html R脚本 十字架小插图
PDF 参考手册
文本 执照

细节

生物浏览 注解,,,,批处理效应,,,,差异性,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,软件,,,,组织血液阵列,,,,转录
版本 1.0.1
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(0.5岁)
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看 R(> = 3.3)
进口 副词(> = 1.50.0),affxparser(> = 1.44.0),AnnotationDbi(> = 1.34.4),生物酶(> = 2.32.0),生物基因(> = 0.18.0),Biocinstaller(> = 1.22.3),DT(> = 0.2),Data.Table(> = 1.9.6),fdrtool(> = 1.2.15),地球(> = 2.38.4),林玛(> = 3.28.17),矩阵(> = 0.50.2),(> = 3.1.2),miniui(> = 0.1.1),奥利戈(> = 1.36.1),潘德(> = 0.6.0),rcolorbrewer(> = 1.1.2),rdrop2(> = 0.7.0),Stringr(> = 1.0.0),SVA(> = 3.20.0),闪亮的(> = 0.13.2)
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,Lydata,,,,org.hs.eg.db,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 CCMAP
构建报告

包装档案

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包源 crossmeta_1.0.1.tar.gz
Windows二进制 crossmeta_1.0.1.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) crossmeta_1.0.1.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/crossmeta/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/crossmeta/
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