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CPVSNP
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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅CPVSNP。
SNP关联p值的基因集分析方法，位于给定基因集中的基因
生物导体版本：3.4
存在基因集分析方法将SNP级关联p值组合为基因集，从而计算每个基因集的单个缔合p值。该软件包实现了仅需要计算出的SNP P值，感兴趣的基因集和相关矩阵（如果需要）的两种此类方法。一种方法（Glossi）需要独立的SNP，另一种（Vegas）可以考虑SNP之间的相关性（LD）。内置的绘图功能可帮助用户可视化结果。
作者：凯特琳·麦克休，杰西卡·拉尔森和杰森·哈克尼
维护者：caitlin mchugh
引用（从r内，输入引用（“ CPVSNP”））：
安装
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文档
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BrowseVignettes（“ CPVSNP”）
| R脚本 | 使用“ CPVSNP”软件包运行基因集分析 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 基因烯，，，，遗传学，，，，基因组变量，，，，途径，，，，软件，，，，统计信息 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（2年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 2.10），GenomicFeatures，，，，gseabase（> = 1.24.0） |
| 进口 | 方法，公司，，，，生物比较，，，，GGPLOT2，，，，plyr |
| 链接 | |
| 建议 | txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，运行，，，，生物基因，，，，报告工具，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | cpvsnp_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cpvsnp_1.6.0.zip |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | cpvsnp_1.6.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/cpvsnp/tree/release-3.4 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cpvsnp/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
