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compcoder
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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅compcoder。
RNASEQ数据模拟，差异表达分析和差异表达方法的性能比较
生物导体版本：3.4
该软件包提供了广泛的功能，用于比较通过不同方法获得的结果进行RNASEQ数据的差异表达分析。它还包含用于模拟计数数据和接口到几个软件包的函数，以执行差异表达分析。
作者：夏洛特·索森（Charlotte Soneson）
维护者：charlotte soneson
引用（从r内，输入引用（“ compcoder”））：
安装
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文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ compcoder”）
| R脚本 | compcoder | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，rnaseq，，，，软件 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（3年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.0.2），SM |
| 进口 | TCLTK，尼特（> = 1.2），降价，，，，rocr，，，，格子（> = 0.16），GPLOTS，，，，gtools，，，，gdata，，，，表情， 网格，克恩斯门茶，，，，大量的，，，，GGPLOT2，，，，Stringr，，，，最模式，，，，EDGER，，，，林玛，，，，vioplot， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，EBSEQ，，，，deseq，，，，deseq2（> = 1.1.31），贝塞克（> = 2.2.0），GeneFilter，，，，Noingsq，，，，TCC，，，，萨姆，，，，NBPSEQ（> = 0.3.0） |
| 系统要求 | |
| 增强 | rpanel，，，，DSS |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | compcoder_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | compcoder_1.10.0.zip |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | compcoder_1.10.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/compcoder/tree/release-3.4 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/compcoder/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
