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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅clusterProfiler。

统计分析和可视化的基因和基因的功能配置集群

Bioconductor版本:3.4

这个包实现方法分析和可视化功能配置(去和KEGG)的基因和基因集群。

作者:Guangchuang Yu (aut (cre),李亘王[所有],乔凡尼达尔奥廖[所有](compareCluster公式接口)

维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

HTML	R脚本	统计分析和可视化的基因和基因的功能配置集群
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,聚类,去,GeneSetEnrichment,KEGG,MultipleComparison,通路,Reactome,软件,可视化
版本	3.2.14
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.1),剂量(> = 3.0.1)
进口	AnnotationDbi,ggplot2,GO.db,GOSemSim(> = 2.0.0),IRanges,magrittr、方法、plyr,qvalue、统计、stats4tidyr,跑龙套
链接
建议	AnnotationHub,BiocStyle,GSEABase,KEGG.db,knitr,org.Hs.eg.db,pathview,ReactomePA,testthat,topGO
SystemRequirements
增强了
URL	https://guangchuangyu.github.io/clusterProfiler
BugReports	https://github.com/GuangchuangYu/clusterProfiler/issues
取决于我
进口我	bioCancer,debrowser,eegc,林肯,MoonlightR,TCGAbiolinks
建议我	ChIPseeker,剂量,GOSemSim,isomiRs,ReactomePA
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	clusterProfiler_3.2.14.tar.gz
Windows二进制	clusterProfiler_3.2.14.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	clusterProfiler_3.2.14.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/clusterprofiler/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/clusterProfiler/
包下载报告	下载数据