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安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“clusterExperiment”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
clusterExperiment
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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅clusterExperiment。
单细胞测序比较聚类
Bioconductor版本:3.4
这个包提供了运行功能,并比较不同集群的单细胞测序数据。
作者:伊丽莎白Purdom (cre, aut cph],大卫。Risso (aut),玛拉约翰逊(施)
维护人员:伊丽莎白Purdom < epurdom stat.berkeley.edu >
从内部引用(R,回车引用(“clusterExperiment”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“clusterExperiment”)
文档
| HTML | R脚本 | clusterExperiment装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类,RNASeq,测序,软件 |
| 版本 | 1.0.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(> = 3.3),方法,SummarizedExperiment |
| 进口 | NMF,RColorBrewer,猿,phylobase,集群统计数据,limma,dendextend,多少,locfdr,matrixStats、图形、平行 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,图,testthat,scRNAseq |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/epurdom/clusterExperiment/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | clusterExperiment_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | clusterExperiment_1.0.0.zip |
| Mac OS X 10.9(小牛) | clusterExperiment_1.0.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/clusterexperiment/tree/release - 3.4 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/clusterExperiment/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
