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此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅快船。
生物导体版本:3.4
使用两步经验方法实现拓扑基因集分析。它利用图形分解理论创建一个结树并重建最相关的信号路径。在第一步中,剪刀根据统计测试对途径的平均值和浓度矩阵选择了重要的途径。然后,它“剪辑”整个识别与特定表型具有最大关联的信号路径的途径。
作者:Paolo Martini
维护者:paolo martini
引用(从r内,输入引用(“快船”)
):
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Browsevignettes(“快船”)
R脚本 | 快船 | |
参考手册 |
生物浏览 | 软件 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(4年) |
执照 | AGPL-3 |
要看 | r(> = 2.15.0),矩阵,,,,图形 |
进口 | 方法,生物酶,,,,RCPP,,,,Igraph,,,,Grbase(> = 1.6.6),qpgraph,,,,kegggraph,,,,公司,,,,rbgl |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,石墨,,,,全部,,,,HGU95AV2.DB,,,,大量的,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | rcytoscape(> = 1.6.3) |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | topaseq |
建议我 | 石墨 |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Clipper_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | Clipper_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | Clipper_1.14.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/clipper/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/clipper/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |