要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ clipper”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

快船

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅快船

基因集分析利用途径拓扑

生物导体版本:3.4

使用两步经验方法实现拓扑基因集分析。它利用图形分解理论创建一个结树并重建最相关的信号路径。在第一步中,剪刀根据统计测试对途径的平均值和浓度矩阵选择了重要的途径。然后,它“剪辑”整个识别与特定表型具有最大关联的信号路径的途径。

作者:Paolo Martini ,gabriele销售,chiara romualdi

维护者:paolo martini

引用(从r内,输入引用(“快船”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ clipper”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“快船”)

PDF R脚本 快船
PDF 参考手册

细节

生物浏览 软件
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(4年)
执照 AGPL-3
要看 r(> = 2.15.0),矩阵,,,,图形
进口 方法,生物酶,,,,RCPP,,,,Igraph,,,,Grbase(> = 1.6.6),qpgraph,,,,kegggraph,,,,公司,,,,rbgl
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,石墨,,,,全部,,,,HGU95AV2.DB,,,,大量的,,,,生物使用
系统要求
增强 rcytoscape(> = 1.6.3)
URL
取决于我
进口我 topaseq
建议我 石墨
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Clipper_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 Clipper_1.14.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) Clipper_1.14.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/clipper/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/clipper/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网