要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“chimera”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

嵌合体

此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅嵌合体

用于融合产品的二次分析的包装

Bioconductor版本:3.4

该套餐有助于融合产品事件的表征。它允许从以下融合搜索器导入融合数据结果:Chimerascan,Bellerophontes,Defuse,Fusionfinder,FusionHunter,Mapsplice,Tophat-Fusion,Fusionmap,Star,Rsubread,FusionCatcher。

作者:Raffaele A Calogero,Matteo Carrara,Marco Becuti,Francesca Cordero

维护者:Raffaele A Calogero

引文(从R内,输入引文(“Chimera”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“chimera”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“Chimera”)

PDF. r script. 嵌合体
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 基础设施软件
版本 1.16.0
在生物导体中以来 BIOC 2.12(R-3.0)(4年)
执照 艺术-2.0
依靠 BioBase.Genomicranges.(> = 1.13.3),RSAMTOOLS.(> = 1.13.1),基因管理, 方法,annotationdbi.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.homo.sapiens.
进口
链接到
建议 生物相投Geneplotter.
系统要求 某些功能需要明星,TOPHAT,Bowtie和SAMTOOLS
加强 rsubread.bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9.txdb.mmusculus.ucsc.mm9.knowngene.bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10txdb.mmusculus.ucsc.mm10.knowngene.Mus.Musculus.bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38.txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene.
URL.
取决于我 onechannelgui.
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 Chimera_1.16.0.tar.gz.
Windows二进制文件 chimera_1.16.0.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.9(mavericks) chimera_1.16.0.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondion-mirror/chimera/tree/release-3.4
包短网址 http://biocidodder.org/packages/chimera/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网