要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“chimera”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅嵌合体。
Bioconductor版本:3.4
该套餐有助于融合产品事件的表征。它允许从以下融合搜索器导入融合数据结果:Chimerascan,Bellerophontes,Defuse,Fusionfinder,FusionHunter,Mapsplice,Tophat-Fusion,Fusionmap,Star,Rsubread,FusionCatcher。
作者:Raffaele A Calogero,Matteo Carrara,Marco Becuti,Francesca Cordero
维护者:Raffaele A Calogero
引文(从R内,输入引文(“Chimera”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“chimera”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“Chimera”)
PDF. | r script. | 嵌合体 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 基础设施那软件 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.12(R-3.0)(4年) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | BioBase.那Genomicranges.(> = 1.13.3),RSAMTOOLS.(> = 1.13.1),基因管理, 方法,annotationdbi.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那homo.sapiens. |
进口 | |
链接到 | |
建议 | 生物相投那Geneplotter. |
系统要求 | 某些功能需要明星,TOPHAT,Bowtie和SAMTOOLS |
加强 | rsubread.那bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9.那txdb.mmusculus.ucsc.mm9.knowngene.那bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10那txdb.mmusculus.ucsc.mm10.knowngene.那Mus.Musculus.那bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38.那txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene. |
URL. | |
取决于我 | onechannelgui. |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | Chimera_1.16.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | chimera_1.16.0.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.9(mavericks) | chimera_1.16.0.tgz. |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocondion-mirror/chimera/tree/release-3.4 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/chimera/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |