# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“cellHTS2”)

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cellHTS2。

分析细胞屏幕- cellHTS的修订版本

Bioconductor版本:3.4

这个包提供了分析工具进行的高通量分析microtitre板格式(包括但不限于384 -孔板)。功能包括数据导入和管理、正常化、质量评估、复制概括和统计得分。一个网页,它提供了一个详细的图形概述数据和分析结果。在我们的工作中,我们应用软件包RNAi屏幕飞和人类细胞和酵母的屏幕库。看到了什么? cellHTS2简介。

作者:Ligia胸罩,Michael Boutros沃尔夫冈•休伯< whuber在embl.de > < m。布特罗斯·dkfz.de >,格雷戈勒加索尔在embl.de > < gpau, Florian Hahne <弗洛里安。在novartis.com hahne >

维修工:约瑟夫·巴里<约瑟夫。巴里在embl.de >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“cellHTS2”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cellHTS2”)

PDF	R脚本	主要装饰图案(完整版):端到端分析细胞的屏幕
PDF	R脚本	细胞的主要装饰图案:端到端分析屏幕
PDF	R脚本	补充:enhancer-suppressor屏幕
PDF	R脚本	补充:多渠道化验
PDF		参考手册

细节

biocViews	CellBasedAssays,预处理,软件,可视化
版本	2.38.0
Bioconductor自	BioC 2.1 (r - 2.6)(9.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),RColorBrewer,Biobase、方法、genefilter,splots,vsn,hwriter,locfit、网格
进口	普拉达,GSEABase,类别,stats4
链接
建议	ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.dkfz.de/signalinghttp://www.ebi.ac.uk/huber
取决于我	coRNAi,imageHTS,staRank
进口我	gespeR,HTSanalyzeR,RNAinteract
建议我	bioassayR,普拉达
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	cellHTS2_2.38.0.tar.gz
Windows二进制	cellHTS2_2.38.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	cellHTS2_2.38.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/cellhts2/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cellHTS2/
包下载报告	下载数据