安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ccrepe”)
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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ccrepe。
Bioconductor版本:3.4
CCREPE(纠正REnormalizaion和排列组合性原则)包的目的是评估的意义一般相似措施组成的数据集。在微生物丰度数据,例如,所有微生物和总丰度;CCREPE设计时考虑到这个约束假定值分配给微生物之间的相似性度量。包有两个功能:ccrepe:计算相似性措施,p和q值的相对含量,虫子在身体一个或两个网站的使用引导和置换矩阵的数据。数控。得分:计算了解共变和co-exclusion模式基于棋盘得分顺序数据的扩展。
作者:艾玛Schwager < emh146 mail.harvard.edu >,克雷格·比<克雷格。乔治·比gmail.com >,乔治Weingart <。在gmail.com weingart >
维护人员:艾玛Schwager <艾玛。schwager gmail.com >,克雷格·比<克雷格。乔治·比gmail.com >,乔治Weingart <。在gmail.com weingart >
从内部引用(R,回车引用(“ccrepe”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ccrepe”)
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browseVignettes (“ccrepe”)
R脚本 | ccrepe | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 生物信息学,宏基因组,软件,统计数据 |
版本 | 1.10.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(3年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可 |
取决于 | |
进口 | infotheo(> = 1.1) |
链接 | |
建议 | knitr,BiocStyle,BiocGenerics,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | ccrepe_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | ccrepe_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.9(小牛) | ccrepe_1.10.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/ccrepe/tree/release - 3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ccrepe/ |
包下载报告 | 下载数据 |