安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“blima”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

blima

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅blima

包的预处理和分析Illumina公司微阵列探测器(珠)级别。

Bioconductor版本:3.4

包blima包括几个Illumina公司微阵列数据的预处理算法。它集中到珠级别分析和提供新方法的分位数正常化不同长度的向量。它提供了各种各样的背景校正方法包括背景减法,RMA卷积和背景异常值删除。它还实现了方差稳定珠级别的转换。也有实现的方法进行数据汇总。它还提供了对探测器进行t方法(珠)水平和微分表达式的探测水平测试。

作者:Vojtech Kulvait

维护人员:Vojtech Kulvait < Kulvait gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“blima”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“blima”)

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PDF R脚本 blima.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列,归一化,预处理,软件
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.0.0)
进口 beadarray(> = 2.0.0),Biobase(> = 2.0.0),BiocGenericsgrDevices统计数据,图形
链接
建议 xtable,blimaTestingData,BiocStyle,illuminaHumanv4.db,光民
SystemRequirements
增强了
URL https://bitbucket.org/kulvait/blima
取决于我
进口我
建议我 blimaTestingData
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 blima_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 blima_1.8.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛) blima_1.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/blima/tree/release - 3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/blima/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网