要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("birta")

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birta

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见birta

转录活性调控的贝叶斯推理

Bioconductor版本:3.4

mRNA分子的表达水平受不同过程的调控,包括转录因子的抑制或激活和microRNAs的转录后降解。birta (Bayesian Inference of Regulation of转录活性调控的贝叶斯推断)利用转录因子和miRNA的调控网络以及mRNA和miRNA的表达数据来预测两种条件下调控活性的切换。采用贝叶斯网络对调控结构进行建模,采用马尔科夫-链-蒙特卡罗方法对活动状态进行采样。

作者:Benedikt Zacher, Khalid Abnaof, Stephan Gade, Erfan Younesi, Achim Tresch, Holger Froehlich

维护程序:Benedikt Zacher < Zacher at lmb.uni-muenchen.de>, Holger Froehlich

引用(从R中,输入引用(“birta”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("birta")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“birta”)

PDF R脚本 转录活性调控的贝叶斯推理
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGraphAndNetwork微阵列测序软件转录
版本 1.18.0
在Bioconductor公司 BioC 2.10 (R-2.15)(5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 limma质量, r (>= 2.10),Biobase、方法
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 birta_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 birta_1.18.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.9(小牛队) birta_1.18.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/birta/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/birta/
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