要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("birta")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见birta.
Bioconductor版本:3.4
mRNA分子的表达水平受不同过程的调控,包括转录因子的抑制或激活和microRNAs的转录后降解。birta (Bayesian Inference of Regulation of转录活性调控的贝叶斯推断)利用转录因子和miRNA的调控网络以及mRNA和miRNA的表达数据来预测两种条件下调控活性的切换。采用贝叶斯网络对调控结构进行建模,采用马尔科夫-链-蒙特卡罗方法对活动状态进行采样。
作者:Benedikt Zacher, Khalid Abnaof, Stephan Gade, Erfan Younesi, Achim Tresch, Holger Froehlich
维护程序:Benedikt Zacher < Zacher at lmb.uni-muenchen.de>, Holger Froehlich
引用(从R中,输入引用(“birta”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("birta")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“birta”)
R脚本 | 转录活性调控的贝叶斯推理 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,GraphAndNetwork,微阵列,测序,软件,转录 |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.10 (R-2.15)(5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | limma,质量, r (>= 2.10),Biobase、方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | birta_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | birta_1.18.0.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.9(小牛队) | birta_1.18.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/birta/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/birta/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |