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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ biovizbase”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Biovizbase

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Biovizbase

可视化基因组数据的基本图形实用程序。

生物导体版本:3.4

BiovizBase软件包旨在为基因组数据提供一组实用程序,配色方案和约定。它是用于生物数据可视化的各种高级包装的基础。这节省了发展努力并鼓励一致性。

作者:Tengfei Yin [AUT],Michael Lawrence [AUT,THS,CRE],Dianne Cook [AUT,THS],Johannes Rainer [CTB]

维护者:迈克尔·劳伦斯(Michael Lawrence)

引用(从r内,输入引用(“ Biovizbase”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ Biovizbase”)

PDF R脚本 Biovizbase简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基础设施,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化
版本 1.22.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(5。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.10),方法
进口 grdevices,统计,,,,HMISC,,,,rcolorbrewer,,,,Dichromat,,,,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges(> = 1.99.28),GenomeInfodB(> = 1.5.14),基因组机(> = 1.23.21),总结性特征,,,,生物弦(> = 2.33.11),rsamtools(> = 1.17.28),基因组签名(> = 1.1.16),GenomicFeatures(> = 1.21.19),AnnotationDbi,,,,变体(> = 1.11.4),Ensembldb(> = 1.3.8)
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,BSGENOME,,,,rtracklayer,,,,ensdb.hsapiens.v75,,,,运行
系统要求
增强
URL
取决于我 咖啡店,,,,QRQC
进口我 气泡,,,,GGBIO,,,,GVIZ,,,,PVIZ,,,,QRQC,,,,RQC
建议我 Cindex,,,,德芬德,,,,derfinderplot,,,,R3CPET,,,,地区报告
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 biovizbase_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 biovizbase_1.22.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.9(Mavericks) biovizbase_1.22.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/biovizbase/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biovizbase/
软件包下载报告 下载统计

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